有一些传统的方法已经被国家明令禁止了 比如使用硫酸铜、漂白l粉、孔雀石l绿等水质改良剂虽然也能对养殖后的废水进行一定的处理，但由于这些方法会对环境产生二次污染，并且有的方法还会对人体造成伤害，现在已经被国家明令禁止了，对环境友好的除污方法才符合国家的生态保护战略。
水产养殖中常规的水质指标
1、温度：由于鱼类的代谢强度和体温的变化，温度直接影响到鱼类的摄食和生长。
适宜的温度，水体中的细菌和浮游植物等生长繁殖迅速，这样就加快了池塘物质的循环，能为鱼类提供丰富的天然饵料，十分有利于鱼类的生长和发育。
池塘的溶氧量随着水温的升高而降低。
一般情况下水温度每升高10℃，药毒性会增加2—3倍。
2、盐度：盐度是指海水中溶解物质质量与海水质量的比值。因盐度不能直接测量，所以，随着盐度的测定方法的变化和改进，在实际应用中引入了相应的盐度定义。
盐度作为水产养殖环境的一个重要理化因子，与养殖动物的渗透压、生长、发育关系密切。
水产养殖污染现状 “水产养殖环境污染由外源性和养殖自身污染构成”，自身污染源于养殖过程中的投入品、池底污泥及水产排泄物，而外源性污染源于生活污染、农业面源污染和工业污染等。除了不可抗力，外源性污染源主要是通过养殖进水混入养殖水体，造成养殖用水水质从源l头不达标的窘境。
根据水产养殖问题的实践调研显示，很多养殖者将禁止直接排放的生活污水、生产废水等注入鱼塘，并通过植物进化降低或降解污染物使其符合养殖废水排放标准进而达致合法排污的目的。
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